Церковь Афанасия Великого расположена на склоне горы Митридат с северной стороны, на улице Пантикапейской в Керчи. Это одна из старейших церквей города, возведена она была в 1863 году в честь александрийского архиепископа. Деньги на строительство храма пожертвовал один из местных жителей – губернский секретарь Афанасий Маринаки.

В 1864 году церковь, построенную на территории городского кладбища, освятили так, как того пожелал Маринаки, а ее содержание в дальнейшем велось на средства, которые несколькими годами ранее благотворитель внес на хранение в опекунский совет.

С приходом советской власти, в 1923 году, кладбище снесли, храм Афанасия Великого был закрыт, а в 30-х годах 20 века его и вовсе разграбили, все ценные вещи исчезли из святыни. Богослужения возобновились уже в период Великой Отечественной войны, сначала они проводились для румынских солдат.

В годы оккупации здание церкви претерпело существенные разрушения, однако впоследствии здесь были проведены реставрационные и восстановительные работы.

На сегодняшний день церковь Афанасия Великого является одной из красивейших в Керчи. Во дворе храма есть небольшой сад, а также несколько старинных могил, часть из них – безымянные. Здесь работает церковная лавка, а также воскресная школа. Помещение церкви не очень большое, способно вместить около 350 прихожан. Здесь хранится большое количество икон, большинство которых в послевоенные годы принесли сюда местные жители. Многие иконы представляют собой серьезную ценность.